Abstinencia sexual 2-7 días independiente de la edad del paciente. El paciente debe orinar y lavarse las manos antes de la recolección. Realizar aseo de genitales con agua y jabón antes de la emisión de la muestra. Evitar restos de jabón y secar antes de la emisión de la muestra.
Producir la muestra vía masturbación sin usar lubricante artificial y recolectarla en un contenedor de plástico de boca ancha y estéril. Es importante que se recolecte la totalidad del eyaculado. Se recomienda que la toma de muestra para estudios microbiológicos se realice previo a la administración de cualquier tratamiento antibiótico. En caso de que el paciente haya sido sometido a tratamiento antibiótico antes de la realización del estudio, se sugiere suspenderlo 3 días previos a la toma de muestra. El que un paciente se encuentre bajo tratamiento antibiótico al momento de la toma de muestra, no debe ser considerado como criterio de rechazo, sin embargo, esta condición debe ser avalada por el médico tratante, ya que los resultados obtenidos pueden arrojar falsos negativos. Dicha información tendrá que ser indicada al personal de laboratorio.